Anthropic借助Claude解析首个原核Vault三维结构,纯化时间缩至90分钟
摘要
Anthropic生物学团队利用Claude辅助研究,首次解析出原核生物Vault三维结构,发现噬菌体L05蛋白可组装成含96个蛋白副本、约9.5兆道尔顿的颗粒,纯化时间从3天缩短至90分钟。
Anthropic于11月5日公布一项生物学研究进展:其团队在Claude辅助下,首次解析出与 prokaryotes(原核生物)相关的Vault(穹窿颗粒)三维结构。Vault是细胞内最大的核糖核蛋白颗粒之一,自1986年被发现以来,其生物学功能在约40年间始终未明。人类细胞中约含1万个此类颗粒,典型尺寸约67纳米长、40纳米宽。
研究团队在约150亿个预测蛋白序列中检索主要穹窿蛋白(MVP)的同源物,于29个细菌门和4个古菌门内锁定候选序列,并从中挑选44个蛋白开展实验室测试。结果显示,7个在大肠杆菌中表达的蛋白成功组装为穹窿样颗粒;冷冻电镜确认了其中4个候选物的完整闭合结构,两个源自细菌,两个源自噬菌体。
团队重点解析了噬菌体来源的L05蛋白,结构分辨率达3.2埃。L05穹窿由96条蛋白链构成,每条链含7个壁重复序列,而人类MVP为9个。该颗粒长54.5纳米、宽47.5纳米,外形更接近球形,内部体积比人类穹窿大约25%,总分子质量约9.5兆道尔顿(MDa)。团队还通过向L05中插入额外壁重复序列,获得了L05+。
值得注意的是,Claude在此次研究中承担了辅助角色,使蛋白纯化时间从3天压缩至90分钟。这一效率提升,为结构生物学中繁琐的样品制备环节提供了新的加速路径,也显示出AI模型在基础科研流程中的实际介入价值。
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