蛋白质设计正从结构预测迈向功能创造。由美国华盛顿大学、英国牛津大学及英伟达等机构组成的国际联合研究团队，开发出可按单个原子组合进行设计的生成式人工智能系统RFdiffusion3，其详细设计方案已于当地时间16日刊登在国际期刊《科学》上。

据披露，研究团队利用RFdiffusion3全新设计的蛋白质，能够在真实化学反应中表现出预期功能，这意味着AI设计产物已通过实验层面的功能验证。该团队已于2025年12月3日将RFdiffusion3开源，供外界使用。

RFdiffusion3的通讯作者为华盛顿大学教授戴维·贝克（David Baker），他因在计算机预测蛋白质结构方面的贡献获得2024年诺贝尔化学奖。其标志性成果之一是蛋白质结构预测AI系统RosettaFold，该系统通过学习氨基酸之间的空间关系来预测蛋白质三维结构；2023年发布的RFdiffusion1与2025年发布的RFdiffusion2均依托这一结构预测基础。

从预测已有蛋白质结构，到设计具备目标结构与功能的全新蛋白质，AI在蛋白质研究中的角色正在延伸。RFdiffusion3将建模精度推进至原子层面，并覆盖核酸设计，为相关研究提供了新的工具路径。